Персона 3: Новое начало

В определённое время суток наступает Тёмный час - временной промежуток, о существовании которого большинство людей не подозревает. Те, кто не находится в защитном состоянии во время этого периода, сталкиваются с опасными существами, называемыми Тенями. Некоторые люди способны пробудить Персону - особую силу для борьбы с этими созданиями. Группа таких людей, называемая SEES, ставит целью выяснить причину возникновения Тёмного часа.

Переведённый ученик Макото Юуки начинает проживание в общежитии Иватадай. После атаки сильной Тени его Персона пробуждается. Макото присоединяется к SEES и вместе с другими участниками группы защищает человечество от Теней. Деятельность группы направлена на предотвращение аномалии, известной как Тёмный час.